Paymogo está comunicada por carretera con las localidades onubenses de Santa Bárbara y Puebla de Guzmán. Además, tambíen se encuentra conectado con Portugal a través del Puente Internacional que cruza la Rivera del Chanza.
Para llegar desde el Norte, hay que enlazar con la A-495 hasta la localidad de Santa Bárbara y, desde aquí, llegar hasta Paymogo a través de la provincial HU-7401. Si se viene del Sur, o bien se toma esta misma A-495 hasta la citada Santa Bárbara, o la A-499 hasta la localidad de Puebla de Guzmán, desde donde enlazaremos con la carretera provincial HU-5401 hasta Paymogo.
Hay un servicio de ida y vuelta diario de autobús entre Paymogo y Huelva capital que presta la empresa de transportes DAMAS. El horario es el siguiente:
PAYMOGO-HUELVA
- De lunes a Viernes: a las 6.50h y las 15.10h.
- Sábados: a las 7.35h.
- Domingos: a las 17.10h.
HUELVA-PAYMOGO
- De lunes a viernes: a la 13.00h y a las 15.30h.
- Sábados: a las 17.30h.
- Domingos: a las 15.00h.